Intégration des données rapportées par les patients (PROMs) et des données cliniques pour faire progresser les données probantes en vie réelle en oncologie
Chercheuse principale : Sylvie Lambert
Institution : Centre de recherche de l’Hôpital St-Mary’s
Sponsor : PROVEM
Contexte scientifique
Les essais cliniques randomisés constituent la référence pour l’évaluation de l’efficacité des traitements anticancéreux. Toutefois, réalisés dans des environnements contrôlés et auprès de populations sélectionnées, ils reflètent imparfaitement la diversité des trajectoires observées en pratique clinique réelle.
Depuis 2015, le département d’oncologie de l’Hôpital St-Mary’s collecte systématiquement des données rapportées par les patients (Patient-Reported Outcome Measures – PROMs) dans le cadre des soins. La mobilisation structurée de ces données, combinée aux informations clinico-administratives et biologiques longitudinales, offre une opportunité unique de mieux caractériser les trajectoires réelles de soins et d’évaluer l’impact des traitements au-delà des conditions contrôlées des essais.
Toutefois, l’intégration de données structurées et non structurées à grande échelle, notamment à partir de notes cliniques, demeure un défi méthodologique majeur en vie réelle et nécessite des approches analytiques avancées.
Objectifs
Ce projet vise à développer une approche intégrée d’analyse des trajectoires cliniques combinant données rapportées par les patients, données cliniques et extraction d’informations issues de données non structurées.
Il cherche également à évaluer la valeur prédictive des mesures précoces rapportées par les patients d’anticiper les résultats cliniques et la tolérance aux traitements en contexte réel.
Population et données mobilisées
- Population :
Patients adultes suivis en oncologie à l’Hôpital St-Mary’s.
Environ 1 500 patients, avec des données longitudinales couvrant la période 2015–2025 selon la disponibilité des bases cliniques et des PROMs. - Données :
- Données PROM (ESAS et questionnaires secondaires)
- Données clinico-administratives hospitalières (diagnostics, visites, hospitalisations)
- Données de laboratoire longitudinales
- Données d’exposition thérapeutique
- Notes cliniques et rapports médicaux en format PDF
La mobilisation de plusieurs dizaines de milliers de documents cliniques non structurés à l’échelle d’une cohorte réelle constitue un levier unique pour enrichir l’analyse des trajectoires de soins.
Approche méthodologique
Il s’agit d’une étude rétrospective basée sur l’intégration et la mobilisation des données longitudinales multi-sources.
Les données structurées et non structurées sont jumelées à l’aide d’un identifiant hospitalier, puis pseudonymisées avant analyse dans un environnement sécurisé conforme aux exigences réglementaires et éthiques applicables. Les informations pertinentes contenues dans les notes cliniques sont extraites à l’aide de modèles de langage (LLM) déployés localement dans un environnement sécurisé, permettant l’analyse structurée de données textuelles à grande échelle.
Les trajectoires sont modélisées à l’aide de :
- Modèles de trajectoires latentes multivariées (LCGA / GBTM)
- Méthodes de clustering non supervisé (k-means, DBSCAN, agglomératif)
- Modèles de survie (Kaplan–Meier, modèles de Cox)
- Analyses longitudinales couplées aux événements cliniques
Cette approche permet d’intégrer des dimensions cliniques habituellement non accessibles dans les bases de données structurées, améliorant ainsi la profondeur et la précision des analyses en vie réelle.
Ce projet constitue un démonstrateur de la capacité de PROVEM à intégrer et analyser des données complexes multi-sources, incluant des données non structurées, à des fins de recherche et d’évaluation en vie réelle.
Statut du projet
Phase actuelle : mise en place opérationnelle et préparation de l’extraction et de l’intégration des données multi-sources.
Prochaine étape : intégration des bases et déploiement du pipeline d’extraction des variables issues des notes cliniques.
Signature institutionnelle
PROVEM est une plateforme dédiée à la mobilisation et à l’analyse de données de vie réelle en oncologie au Québec, intégrant des données cliniques, administratives et rapportées par les patients afin de produire des analyses multi-échelles pour éclairer la prise de décision.